牡丹江第一大學是牡丹江師范大學，排名第二的是牡丹江醫(yī)學院，排名第三的是黑龍江農(nóng)業(yè)經(jīng)濟職業(yè)學院，以下為具體名單，以供參考。

1、牡丹江師范學院

牡丹江師范學院，簡稱牧師園，位于牡丹江市，是國家級語言文字標準化示范學校、黑龍江省東南部教師教育研究中心、基礎教育研究中心和繼續(xù)教育培訓中心、黑龍江省對俄經(jīng)貿(mào)人才培養(yǎng)基地。

牡丹江師范學院創(chuàng)建于1958年，通過東北農(nóng)學院嫩江分校、北安師范學院、寧安師范學院、牡丹江師范學院等發(fā)展階段。1995年9月，學校遷至牡丹江市。2006年，學校獲批碩士學位授予單位。

2、牡丹江醫(yī)學院

牡丹江醫(yī)學院位于黑龍江省牡丹江市，是黑龍江省一所普通本科醫(yī)學院校，是黑龍江省特色應用型本科大學建設單位、全國首批卓越醫(yī)生教育培養(yǎng)計劃試點高校，2015年獲得教育部臨床醫(yī)學專業(yè)認證，有效期6年。

學校始建于1946年，前身為牡丹江區(qū)醫(yī)院、黑龍江省衛(wèi)生干部進修學校始建于1956年，1958年聯(lián)合創(chuàng)辦，經(jīng)歷 牡丹江醫(yī)學院（1958-1962）、牡丹江衛(wèi)生學校（1962-1978）、牡丹江醫(yī)學院（1978-1986）、牡丹江醫(yī)學院（1986-）及其他歷史時期，2013年獲得碩士學位授予權。

3、黑龍江農(nóng)業(yè)經(jīng)濟職業(yè)學院

黑龍江農(nóng)業(yè)經(jīng)濟職業(yè)學院，經(jīng)省政府批準、教育部注冊、面向全國招生的公辦全日制綜合性高等教育機構，是國家示范性高等職業(yè)院校、第二批國家現(xiàn)代學徒制試點單位、《中國特色高水平職業(yè)學校及專業(yè)建設規(guī)劃》高校建設。

學院成立于1958年，前身為東北農(nóng)學院牡丹江分校，本科制；1962年改建為中專；2002年2月經(jīng)省政府批準，黑龍江農(nóng)業(yè)經(jīng)濟職業(yè)學院成立。2008年，學校經(jīng)財政部批準、教育部確定為國家示范性高職院校建設單位。2016年8月，入選第二批國家現(xiàn)代學徒制試點單位。2019年12月，由教育部、財政部列入第三類高水平專業(yè)群體建設單位（A級）。

4、黑龍江幼兒師范高等?？茖W校

黑龍江幼兒師范高等?？茖W校，位于黑龍江省牡丹江市，是一所集幼兒師范教育和普通師范教育于一體的學前師范學校，一所為全國培訓學前教育和小學教育教師的技工學校。

學校的歷史可以追溯到1906年，清政府在寧古塔二等小學設立附設師范學校，后來，寧安師范學校、牡丹江幼兒師范學校、牡丹江師范學校合并為三所學校。2006年3月23日，省高等學校設置評審委員會全票通過，黑龍江省人民政府2006年4月30日致函教育部，申請設立黑龍江幼兒師范高等專科學校。

5、牡丹江學院

牡丹江學院，位于黑龍江省牡丹江市，成立于1983年，經(jīng)黑龍江省人民政府批準，教育部注冊，牡丹江市人民政府主辦的一所綜合性全日制普通高等院校。

1983年7月，黑龍江省高等教育局批準設立牡丹江大學。1984年8月，牡丹江學院與市行政干部學校合并。1985年8月，學校新教學樓落成，擁有了自己的教學樓，告別委托學校、借地辦學、聯(lián)合辦學的歷史。1986年6月，牡丹江市政府決定將市職工大學并入牡丹江學院。1991年5月，牡丹江廣播電視大學并入牡丹江大學。2012 年 11 月 15 日，牡丹江大學申請升格為應用型本科院校獲黑龍江省政府批準列入國家“十二五”規(guī)劃。2019 年 8 月 5 日，牡丹江大學醫(yī)療保健學院成立暨揭牌儀式在牡丹江衛(wèi)生學校舉行，學院的成立結束了牡丹江沒有高等醫(yī)學院校的歷史。

6、黑龍江林業(yè)職業(yè)技術學院

黑龍江林業(yè)職業(yè)技術學院，位于黑龍江省牡丹江市，經(jīng)黑龍江省政府批準、教育部注冊，公立學校面向全國招生、全日制普通高等職業(yè)院校。

學院成立于1958年，2001年由原牡丹江林業(yè)學校創(chuàng)辦、牡丹江林業(yè)師范學校、牡丹江林業(yè)干部學校、東京市林業(yè)機電專門學校、牡丹江林業(yè)技工學校五所學校合并升格為高職院校。學院是教育部人才培養(yǎng)評估“優(yōu)秀”院校、黑龍江省示范性高職院校，是黑龍江省高水平職業(yè)院校建設單位、教育部第二批現(xiàn)代學徒制試點院校。2016年8月，入選第二批國家現(xiàn)代學徒制試點單位。

7、黑龍江商業(yè)職業(yè)學院

黑龍江商業(yè)職業(yè)學院，位于黑龍江省牡丹江市，是一所公辦全日制普通高等院校，是教育部“1+X”證書制度試點院校、黑龍江省企業(yè)管理應用型人才培養(yǎng)基地、黑龍江省高技能人才培養(yǎng)基地。

學校前身可以追溯到1958年8月成立的黑龍江蠶桑學校，后來又去了黑龍江省役校、牡丹江商學院、黑龍江財貿(mào)學校等時期，2003年3月，升格為黑龍江商業(yè)職業(yè)學院。